Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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