Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Prdm16A2A935 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.2 ms