Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm2A2A7B5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms