Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms