Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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