Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms