Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-BlV9GXR0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-BlV9GXR0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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