Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms