Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms