Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms