Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tulp1Q9Z273 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms