Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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