Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms