Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms