Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms