Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cldn9Q9Z0S7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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