Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms