Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp2Q9Z0E6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms