Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms