Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms