Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbck1Q9WUB0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms