Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms