Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms