Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psma1Q9R1P4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma1Q9R1P4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms