Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms