Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms