Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms