Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Nek3Q9R0A5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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