Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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