Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms