Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms