Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxnb3Q9QY40 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms