Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nufip1Q9QXX8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms