Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim44Q9QXA7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms