Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.5 ms