Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdcQ9QW08 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms