Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms