Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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