Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms