Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms