Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rabgef1Q9JM13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rabgef1Q9JM13 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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