Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms