Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
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