Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Col5a3Q9JLI2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Col5a3Q9JLI2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Col5a3Q9JLI2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms