Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms