Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms