Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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