Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin1Q9JKF6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms