Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms