Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms